Per essere potrebbe anche trattarsi di problemi di natura elettrica, l'umidità e l'acqua in generale non è amica dei circuiti elettrici..però nel tuo specifico caso è da vedere.
Intanto se tutto è in ordine partendo dalle pipette non dovrebbero creare problemi perché ben isolate,io talvolta l'ho lavata col getto dell'acqua senza alcun riguardo e non avuto il benché minimo problema nel riavviarla e viaggiare subito dopo.
Potresti boh tipo controllare l'airbox e tutto il percorso dell'aria in generale fino ai carbu,magari qualche piccola crepa da cui passa umidita.
Si va per ipotesi francesco... i carbu controllati se son a posti tarati ottimamente/sincronizzati ecc puoi esser sicuro non dipenda da loro..